More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3948 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  100 
 
 
454 aa  902    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  69.61 
 
 
446 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  62.44 
 
 
432 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  56.55 
 
 
466 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  58.49 
 
 
451 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  56.78 
 
 
469 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  58.49 
 
 
451 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  57.24 
 
 
464 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  53.05 
 
 
440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  51.7 
 
 
455 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  54.02 
 
 
440 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  50.8 
 
 
440 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  50.57 
 
 
440 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  49.66 
 
 
441 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  48.17 
 
 
457 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  50.35 
 
 
457 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  38.1 
 
 
560 aa  273  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  36.6 
 
 
767 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  36.32 
 
 
629 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9634  predicted protein  33.99 
 
 
480 aa  242  9e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  30.75 
 
 
468 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1420  hypothetical protein  31.74 
 
 
486 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1402  hypothetical protein  29.34 
 
 
495 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.55 
 
 
434 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  27.88 
 
 
433 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1060  ABC transporter  28.85 
 
 
495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  27.71 
 
 
433 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  27.23 
 
 
432 aa  170  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  34 
 
 
437 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  35.31 
 
 
455 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  26.39 
 
 
438 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  30.79 
 
 
455 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  35.38 
 
 
543 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  33.02 
 
 
453 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  32.37 
 
 
443 aa  156  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  36.28 
 
 
440 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  27.1 
 
 
441 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  31.68 
 
 
473 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  34.4 
 
 
447 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  30.99 
 
 
445 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  31.11 
 
 
481 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  28.96 
 
 
448 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  30.51 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  34.92 
 
 
473 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  33.04 
 
 
470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  30.18 
 
 
448 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  31.42 
 
 
448 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  31.97 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  30.72 
 
 
499 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 
438 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  30 
 
 
483 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  34.53 
 
 
477 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  31.35 
 
 
574 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  32.79 
 
 
447 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.16 
 
 
445 aa  136  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  30.85 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  30.41 
 
 
462 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  31.92 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  30.79 
 
 
476 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.77 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  31.72 
 
 
438 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  33.98 
 
 
485 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  28.42 
 
 
452 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  22.95 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  30.88 
 
 
456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  29.64 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  29.64 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  31.38 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  27.36 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  29.32 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.1 
 
 
559 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  32.86 
 
 
454 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  30.4 
 
 
456 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  29.43 
 
 
456 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  29.01 
 
 
454 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  29.43 
 
 
456 aa  126  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  29.93 
 
 
454 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  26.43 
 
 
445 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  24.2 
 
 
440 aa  123  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  28.73 
 
 
470 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  30.25 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  27.85 
 
 
473 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  28.01 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  36.33 
 
 
556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  31.48 
 
 
565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.15 
 
 
559 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  24.48 
 
 
440 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  22.67 
 
 
433 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  26.46 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03381  ABC transporter substrate binding protein  30.58 
 
 
574 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.11 
 
 
565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.11 
 
 
565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  28.52 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2246  predicted protein  30.46 
 
 
299 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0990218  normal  0.121296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  31 
 
 
556 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.5 
 
 
563 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  28.39 
 
 
564 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  28.52 
 
 
606 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.2 
 
 
530 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>