230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3541 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  65.62 
 
 		 516 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  73 
 
 		 509 aa  704    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  78.12 
 
 		 522 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 526 aa  1058    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  52.27 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  55.33 
 
 		 495 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  53.52 
 
 		 514 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  53.91 
 
 		 513 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  54.85 
 
 		 530 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  55.63 
 
 		 485 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  46.88 
 
 		 517 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  46.86 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  46.86 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  48.55 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  49.8 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  48.47 
 
 		 513 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  48.55 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  48.55 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  46.4 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  49.18 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  46.01 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  46.06 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  45.56 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  43.18 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  41.31 
 
 		 505 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  41.08 
 
 		 505 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  40.61 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  41.67 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  48.87 
 
 		 450 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  37.67 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  41.14 
 
 		 506 aa  322  8e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  41.48 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  40.13 
 
 		 516 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  41.36 
 
 		 509 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  40.67 
 
 		 520 aa  317  5e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  43.23 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  42.27 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  39.83 
 
 		 512 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  41.18 
 
 		 507 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  37.53 
 
 		 506 aa  299  7e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  40.1 
 
 		 505 aa  297  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.19 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.94 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  32.09 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.23 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.65 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06970  thymidine phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4182  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.34 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  31.63 
 
 		 433 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.38 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3657  thymidine phosphorylase  32.77 
 
 		 438 aa  143  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  29.78 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0609  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.87 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.18 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  27.75 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4177  thymidine phosphorylase  32.24 
 
 		 435 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.64 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  25.48 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.82 
 
 		 434 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.67 
 
 		 435 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.54 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.57 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4307  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.54 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00037416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0370  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.12 
 
 		 439 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3916  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.89 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.74 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  28.89 
 
 		 433 aa  135  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0620  thymidine phosphorylase  29.5 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2254  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.33 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3332  thymidine phosphorylase  29.81 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0662  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.49 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.132104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0600  thymidine phosphorylase  29.33 
 
 		 442 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1042  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.33 
 
 		 434 aa  133  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00204257  decreased coverage  0.0000153983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4195  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.33 
 
 		 434 aa  133  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00109232  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2191  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  28.68 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1744  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  25.94 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3342  thymidine phosphorylase  31.14 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6093  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.9 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0759218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  30.58 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1840  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  26.88 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.166082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.51 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  29.63 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4465  thymidine phosphorylase  35 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173869  normal  0.54283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0877  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  25.38 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0834684  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002630  thymidine phosphorylase  28.85 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.957831  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.29 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03376  thymidine phosphorylase  28.85 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.08 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.615956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1928  thymidine phosphorylase  28.84 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.939437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.75 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  26.59 
 
 		 432 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.67 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.93 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0651  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.91 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0617  thymidine phosphorylase  33.17 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.640469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1625  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.26 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2591  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.65 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>