143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0882 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0882  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  642    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1214  hypothetical protein  46.75 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  36.23 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  36.23 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  29.91 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.88 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25.89 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.13 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  28.48 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  22.38 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  23.63 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  27.81 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  22.49 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  22.26 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  25.71 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  26.24 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  21.12 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  23.48 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1694  hypothetical protein  23.95 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  22.64 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  31.71 
 
 		 542 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  22.64 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.34 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  26.28 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  26.67 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.16 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  29.75 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  21.79 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  24.9 
 
 		 366 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  21.43 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  24.32 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.33 
 
 		 438 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  24.74 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.71 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  21.65 
 
 		 412 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  24.55 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  24.7 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  29.11 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  23.79 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.89 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  22.49 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  22.69 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  28.24 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  21.26 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  23.72 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  27.87 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  22.01 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  21.86 
 
 		 371 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  29.2 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  23.21 
 
 		 529 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  21.64 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  24.89 
 
 		 434 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.1 
 
 		 348 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  25.07 
 
 		 405 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  22.62 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  20.85 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  22.52 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  20.89 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.14 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  21.21 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.22 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  23.6 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  23.2 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  22.42 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  25.68 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.67 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.31 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  20.71 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4272  hypothetical protein  23.85 
 
 		 374 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  23.98 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.17 
 
 		 373 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  24.22 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0960  protein of unknown function UPF0118  22.56 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  20.3 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  21.28 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 396 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  22.74 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.68 
 
 		 376 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  25.68 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  20 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2070  hypothetical protein  25.71 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  22.68 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  22.86 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  22.29 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  21.05 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2589  hypothetical protein  21.17 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  21.05 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  21.05 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0172  hypothetical protein  27.82 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000263309  normal  0.0370984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0263  protein of unknown function UPF0118  22.92 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.120153  normal  0.560864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  22.63 
 
 		 486 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  23.16 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4853  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>