173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3005 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  40.1 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  32.7 
 
 		 213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  37.32 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  32.2 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  34.02 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  29.07 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  29.24 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  32.68 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.19 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  31.94 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.89 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  34.63 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.01 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.33 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.96 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  29.63 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.65 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.51 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  32.58 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.34 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.63 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  28.51 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.88 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  29.82 
 
 		 333 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.8 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  25.1 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.11 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.84 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.84 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.84 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.84 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.84 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.19 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.27 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  27.91 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.19 
 
 		 243 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.23 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  27.48 
 
 		 347 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  27.4 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.9 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.03 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30.13 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.88 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.63 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  29.33 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  32.29 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.27 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  32.89 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  25.81 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.73 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35.04 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  30.59 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  29.05 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  27.07 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  27.07 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  29.87 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  27.91 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  28.3 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  30.84 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.58 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  29.86 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  27.6 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  28.97 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.94 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  28.63 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  29.24 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  29.49 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  30.4 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  35.48 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  24.12 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  27.5 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  26.18 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  26.13 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  31.13 
 
 		 311 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  25.57 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  25.47 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.64 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  25.32 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  35.04 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  28.31 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  29.95 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  30.19 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  23.29 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  29.6 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  26.61 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  25.22 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  32.47 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  23.83 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  28.75 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  28.64 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  32.39 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  22.27 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  27.03 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>