More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2368 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
378 aa  763    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
376 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.82 
 
 
379 aa  255  9e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
379 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.56 
 
 
380 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 
396 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
421 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
390 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
380 aa  199  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  38.44 
 
 
371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
387 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
402 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
411 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.89 
 
 
390 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
374 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  37.89 
 
 
383 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
393 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  41.89 
 
 
801 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  38.75 
 
 
802 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
379 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
402 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
378 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  30.97 
 
 
394 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
378 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  30.2 
 
 
395 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
393 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
408 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  29.31 
 
 
398 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
471 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
365 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
402 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
364 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
410 aa  106  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
549 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.49 
 
 
752 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
433 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
373 aa  99.8  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  33.02 
 
 
461 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  31.07 
 
 
480 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
495 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.41 
 
 
1099 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27 
 
 
403 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 
1101 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
648 aa  92.8  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.6 
 
 
1115 aa  92.8  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  30.54 
 
 
497 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.71 
 
 
1115 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.3 
 
 
927 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.3 
 
 
1119 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
509 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.3 
 
 
1115 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  30.6 
 
 
421 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
428 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.3 
 
 
872 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.55 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  30.17 
 
 
421 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.55 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 
1120 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  30.17 
 
 
421 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
789 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
789 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  36.93 
 
 
505 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
789 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.63 
 
 
1154 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  29.86 
 
 
478 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.98 
 
 
411 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  36.93 
 
 
520 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  29.17 
 
 
694 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
1115 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  36.93 
 
 
662 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.18 
 
 
1124 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  40.65 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  35.8 
 
 
633 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
328 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
520 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
520 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
1002 aa  79.7  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
502 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
446 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>