179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1553 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1553  putative integrase/recombinase  100 
 
 		 343 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4680  integrase family protein  48.77 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6280  integrase family protein  50.15 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2995  integrase family protein  37.89 
 
 		 323 aa  173  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.941848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2304  phage integrase  38.19 
 
 		 362 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327568  normal  0.0181167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2466  integrase family protein  36.39 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0580014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0918  integrase family protein  38.08 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4157  integrase domain-containing protein  38.15 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118927  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1908  phage integrase family protein  37.29 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1962  AP endonuclease  32.7 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3359  integrase family protein  38.02 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4367  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4316  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1698  Phage integrase  32.89 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2185  integrase family protein  33.51 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0291516  hitchhiker  0.00000847111 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3968  phage integrase family protein  31.51 
 
 		 347 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  31.83 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02951  Phage integrase  30.1 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6972  integrase family protein  29.58 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0164563  normal  0.0336098 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4820  phage integrase family protein  31.12 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6146  integrase family protein  31.52 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9008  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4195  phage integrase  29.82 
 
 		 408 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0564405  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4576  phage integrase  29.88 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4792  integrase family protein  32 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00356022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4548  phage integrase  29.48 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.832393  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8006  integrase protein  28.4 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4358  phage integrase  29.52 
 
 		 408 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7008  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1996  phage integrase family protein  28 
 
 		 369 aa  99.4  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4579  phage integrase  29.15 
 
 		 406 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.18624  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4239  hypothetical protein  31.75 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0653636  normal  0.519885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2094  integrase family protein  27.41 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000349759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1943  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171548  normal  0.0940691 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  30.25 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3277  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3751  integrase family protein  29.77 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2033  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3434  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1883  site-specific recombinase XerD-like  29.01 
 
 		 649 aa  94.7  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1382  Phage integrase  28.83 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2384  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4027  integrase family protein  30.3 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0008  DNA integration/recombination/inversion protein  27.91 
 
 		 314 aa  92.8  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.856285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2480  integrase family protein  29.81 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1674  phage integrase family protein  30.13 
 
 		 330 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2380  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.032696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2082  integrase family protein  26.14 
 
 		 371 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.024543  hitchhiker  0.000210845 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8481  integrase family protein  30.39 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383754  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4511  phage integrase  30.93 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2263  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00650578  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7902  integrase family protein  30.39 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  25.7 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2276  integrase family protein  31.35 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00370914  hitchhiker  0.000967634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2244  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5281  integrase family protein  30.36 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2976  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0607408  normal  0.0219571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1640  integrase family protein  30.36 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2511  phage integrase  28.22 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5342  putative cointegrate resolution protein S / recombinase  29.56 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5150  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  30.82 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  30.82 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2105  integrase family protein  30.8 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2392  integrase family protein  30.8 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0530338  normal  0.472164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2870  integrase family protein  28.74 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00943332  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2092  phage integrase family protein  25.63 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2249  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6851  integrase family protein  27.92 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100628  normal  0.271303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2926  Phage integrase  30.71 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  30.14 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3404  putative integrase  27.12 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35820  cointegrate resolution protein S  30.12 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000225241  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3058  cointegrate resolution protein S  30.12 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25710  cointegrate resolution protein S  30.6 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3109  cointegrate resolution protein S  28.21 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00637573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3780  integrase family protein  26.65 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325182  normal  0.557184 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6128  integrase family protein  26.49 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1279  integrase family protein  27.54 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4377  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53808 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5646  integrase family protein  28 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.575287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4524  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1972  integrase family protein  30.21 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.713568  normal  0.0793814 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0638  putative phage recombinase  21.41 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0874979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0237  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1987  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3041  cointegrase  24.74 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  27.82 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2261  phage integrase  27.81 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  26.11 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1804  integrase family protein  28.61 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000010936 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3964  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4716  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5431  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.606096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9510  phage-related integrase  25.56 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0464246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.62 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.64 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1991  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02045  Site-specific recombinase XerD-like protein  24.16 
 
 		 424 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.317068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>