113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0580 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 		 400 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  54.39 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  52.02 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  49.26 
 
 		 652 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  48.11 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  45.96 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  47.01 
 
 		 559 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  43.59 
 
 		 762 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  43.63 
 
 		 703 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  43.36 
 
 		 521 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  42.08 
 
 		 854 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  40.23 
 
 		 675 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  41.48 
 
 		 414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  41.02 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  36.26 
 
 		 763 aa  246  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  38.26 
 
 		 472 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  36.76 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  36.8 
 
 		 586 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  35.63 
 
 		 540 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  36.75 
 
 		 540 aa  209  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  35.75 
 
 		 651 aa  202  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  36.32 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  35.44 
 
 		 662 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  33.33 
 
 		 639 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35.5 
 
 		 792 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  33.58 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  34.07 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.89 
 
 		 674 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 		 674 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  30.21 
 
 		 674 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.12 
 
 		 674 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.12 
 
 		 674 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.12 
 
 		 674 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.12 
 
 		 674 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.12 
 
 		 674 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 674 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.12 
 
 		 674 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.12 
 
 		 674 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  31.02 
 
 		 1271 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  31.54 
 
 		 505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  31.46 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  30.42 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.08 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1080 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 652 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 868 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.47 
 
 		 868 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 868 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  32.99 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.25 
 
 		 867 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.84 
 
 		 868 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  36.63 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.38 
 
 		 869 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.76 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  28.34 
 
 		 868 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.19 
 
 		 848 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 863 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  30.62 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  27.36 
 
 		 563 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  31.81 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.27 
 
 		 868 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.87 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  28.31 
 
 		 657 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.53 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.72 
 
 		 848 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 1578 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.34 
 
 		 972 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.23 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.95 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  27.37 
 
 		 855 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.74 
 
 		 861 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.02 
 
 		 499 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  26.94 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  30.22 
 
 		 563 aa  96.3  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 465 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.78 
 
 		 699 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.78 
 
 		 699 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  27.78 
 
 		 699 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  25.38 
 
 		 699 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 		 1443 aa  87  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.13 
 
 		 1362 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  23.49 
 
 		 1782 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  24.95 
 
 		 699 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  22.48 
 
 		 1246 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  22.81 
 
 		 634 aa  80.1  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 904 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  24.08 
 
 		 1146 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.28 
 
 		 1127 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  23.47 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 		 1127 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 		 1127 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.28 
 
 		 1127 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  25 
 
 		 772 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  25.28 
 
 		 1129 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  25.83 
 
 		 1053 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  22.82 
 
 		 1132 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>