99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2380 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  52.96 
 
 		 629 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  64.34 
 
 		 650 aa  826    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 635 aa  1283    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  65.51 
 
 		 637 aa  853    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  44.55 
 
 		 614 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.28 
 
 		 512 aa  107  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.5 
 
 		 840 aa  94.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  24.86 
 
 		 523 aa  92.8  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  28.12 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  30.53 
 
 		 290 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  31.13 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  31.28 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  30.77 
 
 		 290 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  30.26 
 
 		 290 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  29.73 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  28.72 
 
 		 290 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  27.23 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  27.66 
 
 		 875 aa  58.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  35.66 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.73 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.57 
 
 		 287 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.38 
 
 		 287 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.12 
 
 		 440 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.12 
 
 		 440 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  30.37 
 
 		 295 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  26.87 
 
 		 291 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  27.52 
 
 		 440 aa  50.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  27.27 
 
 		 887 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  25.18 
 
 		 291 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  26.32 
 
 		 853 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5592  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.26 
 
 		 198 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  27.01 
 
 		 880 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  31.54 
 
 		 420 aa  49.7  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1096  GTP-binding proten HflX  33.07 
 
 		 392 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  25.4 
 
 		 294 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  25.4 
 
 		 294 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1176  small GTP-binding protein  33.07 
 
 		 392 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668458  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39888  predicted protein  29.3 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.564657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  26.19 
 
 		 856 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  27.78 
 
 		 409 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 460 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  29.41 
 
 		 294 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04860  septin ring protein, putative  38.82 
 
 		 322 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2387  tRNA modification GTPase TrmE  29.89 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.188748  hitchhiker  0.000106684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2301  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.07 
 
 		 382 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.772558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  27.84 
 
 		 539 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  30.15 
 
 		 355 aa  47.4  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 		 440 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  25.95 
 
 		 940 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 		 440 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  26.92 
 
 		 984 aa  46.6  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  26.28 
 
 		 845 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 		 439 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.43 
 
 		 413 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  25.53 
 
 		 884 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1403  hypothetical protein  42.19 
 
 		 328 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29397  predicted protein  29.55 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000110123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1727  GTP-binding protein EngA  30.83 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  25.4 
 
 		 997 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  27.35 
 
 		 845 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  27.05 
 
 		 679 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  27.05 
 
 		 679 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1165  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  29.32 
 
 		 194 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000846962  decreased coverage  3.27635e-26 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  26.32 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  24.48 
 
 		 891 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  26.47 
 
 		 868 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  25.4 
 
 		 294 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  25.93 
 
 		 896 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1430  GTP-binding protein  30.5 
 
 		 390 aa  45.8  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  31.88 
 
 		 300 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  25.93 
 
 		 885 aa  45.8  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  31 
 
 		 310 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3183  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.28 
 
 		 198 aa  45.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  26.14 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01394  Putative uncharacterized proteinSeptin ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1M1]  35.29 
 
 		 342 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74138  septin  32.94 
 
 		 345 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.314588  normal  0.29916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  27.5 
 
 		 881 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0139  translation initiation factor IF-2  26.15 
 
 		 908 aa  44.3  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0333  translation initiation factor IF-2  23.57 
 
 		 620 aa  44.3  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.792261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2708  translation initiation factor IF-2  26.95 
 
 		 908 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.334172  normal  0.377403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  26.56 
 
 		 739 aa  44.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5015  GTP-binding protein EngA  29.63 
 
 		 448 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0320  small GTP-binding protein  22.58 
 
 		 197 aa  44.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1318  translation initiation factor IF-2  25.71 
 
 		 774 aa  44.3  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1311  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.86 
 
 		 198 aa  44.3  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0010673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  26.56 
 
 		 732 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2751  GTP-binding protein, HSR1-related  41.1 
 
 		 549 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.859645  normal  0.205011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4065  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.28 
 
 		 201 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  24.41 
 
 		 936 aa  44.3  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  25.19 
 
 		 894 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  32.39 
 
 		 490 aa  43.9  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6572  hypothetical protein  32.88 
 
 		 574 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19310  small GTP-binding protein  28.91 
 
 		 411 aa  43.9  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00194835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  33.91 
 
 		 458 aa  43.9  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  26.28 
 
 		 889 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  26.14 
 
 		 479 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3901  GTP-binding protein HSR1-related  31.33 
 
 		 581 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368648  normal  0.0698328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  25.19 
 
 		 689 aa  43.9  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>