78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0212 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 316 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  57.05 
 
 		 329 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  54.63 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  53.85 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  55.91 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  53.04 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  53.04 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  51.74 
 
 		 332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  35.28 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  36.16 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  35.14 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  32.23 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  38.89 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  31.9 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  31.5 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  34.5 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  35.62 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  32.43 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  31.08 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  28.31 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  29.83 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  30.3 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  27.51 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.55 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  26.47 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.98 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  21.2 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  31.71 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  25.86 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  30.22 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  21.62 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  23.13 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  28 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.01 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.65 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  24.23 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  22.95 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.6 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  23.97 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  23.97 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  29.6 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.42 
 
 		 332 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.98 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.22 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  24.33 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  25.98 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  24.88 
 
 		 330 aa  45.8  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  28.28 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  20.62 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.22 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  21.29 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.25 
 
 		 602 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.37 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.67 
 
 		 589 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>