More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3767 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  56.22 
 
 
733 aa  709    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  100 
 
 
717 aa  1390    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  47.6 
 
 
766 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  44.09 
 
 
740 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  47.17 
 
 
731 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  44.17 
 
 
805 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  47.2 
 
 
1308 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  45.66 
 
 
738 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  43.1 
 
 
710 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  44.81 
 
 
762 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  38.66 
 
 
758 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  39.37 
 
 
770 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  38.53 
 
 
741 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  41.24 
 
 
796 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  39.22 
 
 
1155 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  40.06 
 
 
751 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  39.6 
 
 
736 aa  425  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  39.76 
 
 
743 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.8 
 
 
724 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  40.22 
 
 
783 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  39.06 
 
 
769 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  39.06 
 
 
769 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  39.38 
 
 
773 aa  419  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  40.14 
 
 
727 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.58 
 
 
740 aa  412  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  38.75 
 
 
738 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  38.41 
 
 
748 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  38.41 
 
 
754 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  38.79 
 
 
778 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  37.98 
 
 
839 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  38.04 
 
 
767 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  38.04 
 
 
767 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  34.21 
 
 
944 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  38.17 
 
 
767 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  33.38 
 
 
1013 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  37.73 
 
 
738 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.85 
 
 
1095 aa  369  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  34.03 
 
 
741 aa  362  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  37.43 
 
 
731 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.79 
 
 
738 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.84 
 
 
997 aa  332  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  36.08 
 
 
953 aa  331  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  29.91 
 
 
730 aa  324  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  30.04 
 
 
730 aa  323  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  30.04 
 
 
730 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  30.04 
 
 
730 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  30.04 
 
 
730 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  30.18 
 
 
730 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  38.36 
 
 
761 aa  316  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  29.61 
 
 
730 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  39.39 
 
 
743 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  29.81 
 
 
730 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  30.08 
 
 
730 aa  313  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  29.81 
 
 
730 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  29.61 
 
 
729 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  38.61 
 
 
757 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  31.65 
 
 
743 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  38.83 
 
 
709 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.46 
 
 
740 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  34.18 
 
 
842 aa  280  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  38.19 
 
 
500 aa  276  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  34.41 
 
 
741 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  34.38 
 
 
751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.38 
 
 
735 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  30.83 
 
 
781 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  36.53 
 
 
966 aa  269  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  35.45 
 
 
979 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  36.86 
 
 
978 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  35.45 
 
 
983 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  35.45 
 
 
983 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  33.15 
 
 
717 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  34.06 
 
 
723 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.52 
 
 
758 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  31.74 
 
 
760 aa  263  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  37.79 
 
 
743 aa  263  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.95 
 
 
743 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.07 
 
 
796 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  33.15 
 
 
752 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  33.16 
 
 
632 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  37.64 
 
 
968 aa  257  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  31.62 
 
 
846 aa  256  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.43 
 
 
704 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  36.35 
 
 
745 aa  252  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  34.04 
 
 
832 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  30.3 
 
 
758 aa  249  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  31.4 
 
 
920 aa  248  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.08 
 
 
749 aa  248  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  31.6 
 
 
737 aa  247  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.52 
 
 
737 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.9 
 
 
743 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  33.58 
 
 
736 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  35.02 
 
 
732 aa  243  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  36.93 
 
 
724 aa  243  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.57 
 
 
726 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.47 
 
 
723 aa  242  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  32.42 
 
 
731 aa  242  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  32.43 
 
 
718 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35 
 
 
761 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  34.16 
 
 
751 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  32.35 
 
 
734 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>