More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3557 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 374 aa  735    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  65.91 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  64.58 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  58.01 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  55 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  53.06 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  50.26 
 
 		 398 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  50.53 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  49.09 
 
 		 389 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  50.56 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  47.13 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  55.26 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  45.62 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  54.52 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  46.68 
 
 		 394 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.31 
 
 		 809 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  49.03 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  46.49 
 
 		 407 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  47.15 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  45.68 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  45.86 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  45.85 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  45.88 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  50.48 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  43.48 
 
 		 394 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  42.86 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.31 
 
 		 729 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  40.86 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.28 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  37.07 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  40.23 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  38.07 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  36.29 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  37.76 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  37.7 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  38 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  37.71 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  33.74 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.08 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.82 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 		 443 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  38.07 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  35.75 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  34.45 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  35.13 
 
 		 430 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.61 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  35.21 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1823  glucose sorbosone dehydrogenase  36.62 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  37.82 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  36.42 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.18 
 
 		 395 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  32.23 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.82 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2198  glucose sorbosone dehydrogenase  36.15 
 
 		 381 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  34.53 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  35.61 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  37.29 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3539  glucose sorbosone dehydrogenase  36.73 
 
 		 381 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  36.83 
 
 		 381 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  32.87 
 
 		 407 aa  149  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.52 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  33.69 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  36.76 
 
 		 387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  38.08 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  36.44 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2014  glucose sorbosone dehydrogenase  35.71 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  37.05 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  36.17 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  35.1 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  34.46 
 
 		 387 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  33.98 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  34.76 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  33.91 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  34.91 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  35.07 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4727  glucose sorbosone dehydrogenase  32.81 
 
 		 403 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635813  normal  0.114158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.35 
 
 		 384 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  35.07 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0283  glucose sorbosone dehydrogenase  34.93 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  31.44 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.81 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.42 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 391 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  33.82 
 
 		 381 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  34.58 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  35.06 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  31.75 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1774  putative glucose dehydrogenase B  34.44 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  32.58 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>