More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1383 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1383  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 642 aa  1311    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 592 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.84 
 
 		 1023 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 1363 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 1027 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1313 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 1199 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.49 
 
 		 810 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 815 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 		 1068 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 614 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1350 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 923 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  34.05 
 
 		 550 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 774 aa  191  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 934 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 1433 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1078 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 602 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 882 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  29.72 
 
 		 645 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1135 aa  187  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 764 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  31.02 
 
 		 1193 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 947 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  28.76 
 
 		 856 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  29.39 
 
 		 736 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 827 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1055 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 643 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1005 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 870 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  30.95 
 
 		 641 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 780 aa  183  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  33.92 
 
 		 835 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 643 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 902 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 765 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 952 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 627 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  29.41 
 
 		 1209 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 827 aa  180  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 736 aa  180  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  27.35 
 
 		 793 aa  180  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  32.52 
 
 		 578 aa  180  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 846 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 		 695 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1204 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  34.49 
 
 		 1001 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1070 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  27.78 
 
 		 900 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.58 
 
 		 631 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 738 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1093 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 874 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 		 864 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 1120 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 968 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1691 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1343  histidine kinase  34.54 
 
 		 713 aa  177  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0921834  normal  0.552971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1093 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 647 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 784 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 896 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 936 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 862 aa  177  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1070 aa  177  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  27.7 
 
 		 968 aa  177  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1271 aa  176  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 645 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  30.35 
 
 		 1177 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  27.67 
 
 		 984 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.94 
 
 		 2213 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 806 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  32.72 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 643 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 902 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  31.51 
 
 		 858 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 846 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 690 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1127 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2280  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 928 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 647 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 801 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  33.8 
 
 		 827 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 		 865 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  29.23 
 
 		 1028 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 604 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 		 1011 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  30.07 
 
 		 588 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 969 aa  174  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 898 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 597 aa  173  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.87 
 
 		 659 aa  173  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 785 aa  173  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>