246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0513 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  54.1 
 
 
184 aa  205  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  50.27 
 
 
183 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  50.27 
 
 
183 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  49.74 
 
 
249 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  48.37 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  48.62 
 
 
180 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  48.62 
 
 
180 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  50 
 
 
182 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.99 
 
 
183 aa  179  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  48.07 
 
 
180 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  47.25 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  45.3 
 
 
180 aa  175  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  46.45 
 
 
183 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  46.41 
 
 
180 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  46.74 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  48.5 
 
 
186 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  50.3 
 
 
184 aa  167  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  48.26 
 
 
188 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.11 
 
 
189 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  46.51 
 
 
182 aa  166  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  50.31 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  46.77 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  43.78 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  41.3 
 
 
184 aa  158  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40.98 
 
 
183 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.95 
 
 
188 aa  157  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  46.39 
 
 
184 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  43.65 
 
 
183 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  46.75 
 
 
185 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  39.89 
 
 
187 aa  151  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  41.99 
 
 
183 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  43.65 
 
 
185 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  42.35 
 
 
189 aa  151  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  41.44 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  46.06 
 
 
186 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  43.09 
 
 
199 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  43.79 
 
 
181 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  43.17 
 
 
186 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  47.65 
 
 
185 aa  148  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  42.62 
 
 
185 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  44.91 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  42.6 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  42.59 
 
 
187 aa  142  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  41.92 
 
 
186 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  45.4 
 
 
187 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  44.71 
 
 
195 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  45.4 
 
 
208 aa  141  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.27 
 
 
195 aa  141  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  41.05 
 
 
197 aa  141  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  46.05 
 
 
189 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  40.66 
 
 
201 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  41.62 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  40.11 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  41.95 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  39.77 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  36.9 
 
 
189 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  42.86 
 
 
196 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  40.83 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40 
 
 
197 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  41.1 
 
 
186 aa  134  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  39.29 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  40.21 
 
 
201 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  37.76 
 
 
198 aa  131  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  40.36 
 
 
187 aa  130  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  35.68 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  39.23 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  36.41 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40.24 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  46.39 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  38.33 
 
 
196 aa  128  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  38.29 
 
 
194 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  40.96 
 
 
197 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  38.95 
 
 
190 aa  124  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  38.29 
 
 
192 aa  124  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  40.23 
 
 
195 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  37.08 
 
 
188 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  37.8 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  38.04 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  37.7 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  40.38 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  42.07 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  38.51 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  31.79 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  38.51 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  38.38 
 
 
200 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  39.31 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  36.31 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  40.68 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  39.1 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  38.82 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  36.32 
 
 
193 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  37.17 
 
 
193 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  32.5 
 
 
187 aa  111  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  36.04 
 
 
212 aa  111  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0316  LemA family protein  40 
 
 
201 aa  111  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  39.64 
 
 
208 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0311  LemA family protein  40 
 
 
201 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  38.64 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  40.57 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>