147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3401 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  50.61 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  50.61 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  50.61 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  50.61 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  50.61 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  50.61 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  48.16 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  45.04 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  47.95 
 
 		 270 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  46.85 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  42.59 
 
 		 276 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  49.59 
 
 		 348 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  47.58 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  44.53 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  43.72 
 
 		 276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  44.26 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  40.87 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  45.12 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  43.63 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  44.44 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  44.18 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  44.18 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  43.24 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  38.72 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  43.78 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  37.74 
 
 		 276 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  34.35 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  42.62 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  41.06 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  37.2 
 
 		 276 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  35.86 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  37.23 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  36.76 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  39.29 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  39.59 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  36.63 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  37.4 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  39.43 
 
 		 285 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  36.19 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  41.06 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  37.19 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.62 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  36.53 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  38.89 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  34.24 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  37.6 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  37.6 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  38 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  33.22 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  37.2 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  37.85 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  37.4 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  33.89 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  31.4 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  34.44 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  30.23 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  31.56 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  30.26 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  34.16 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  26.85 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.23 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  29.56 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  29.03 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.8 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2144  amidohydrolase 2  29.79 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 319 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 319 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  29.08 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.89 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  29.25 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  29.59 
 
 		 313 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2250  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.66 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.03 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  24.38 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1067  hypothetical protein  25.19 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0263007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09180  Amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2295  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6231  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6400  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.904983  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6633  amidohydrolase 2  28.79 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3402  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281098  normal  0.352273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.09 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4879  amidohydrolase 2  29.58 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2077  amidohydrolase 2  28.14 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  25.09 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1831  amidohydrolase 2  25.72 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8657  amidohydrolase 2  26.06 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3464  amidohydrolase 2  25.78 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.344429 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0537  hypothetical protein  21.65 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0233364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  28.28 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  22.96 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1447  hypothetical protein  21.65 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  32.16 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>