102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13508 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  47.57 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  40.74 
 
 		 121 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.23 
 
 		 138 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45 
 
 		 118 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  51.81 
 
 		 122 aa  84.3  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  44.23 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  40.2 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 119 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.53 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  38.61 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.72 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.34 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.332449  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  32.2 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  45.78 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  39.56 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 124 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  29.9 
 
 		 129 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 125 aa  50.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  28.57 
 
 		 117 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  26.37 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  31.73 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  35.29 
 
 		 115 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 287 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  37.8 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.8 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  31.87 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  31.25 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.8 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 421 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  29.23 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  24.3 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 255 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2140  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.32 
 
 		 288 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.64 
 
 		 332 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.65 
 
 		 122 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32440  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279284  normal  0.628291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2748  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  32.08 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  38.75 
 
 		 396 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.29 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 257 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 		 131 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  36.67 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  31.46 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.78 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.3 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  30.67 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5608  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.33 
 
 		 469 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4755  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1689  hypothetical protein  29.7 
 
 		 235 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  34.65 
 
 		 332 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4750  YdbB  36.67 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000160799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4729  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.47 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  34.31 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4359  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 114 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3039  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 134 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762499  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 		 311 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  28.57 
 
 		 171 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 124 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4869  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 333 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4739  YdbB  36.84 
 
 		 110 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4355  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.833469  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4449  cupin 2 domain-containing protein  35.09 
 
 		 110 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000519881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 127 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 130 aa  41.2  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>