More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1817 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  73.11 
 
 		 121 aa  181  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  72.73 
 
 		 123 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  67.52 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 125 aa  166  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  64.41 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  64.04 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  64.04 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  64.04 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 123 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  55.75 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3077  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.74045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 397 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.14 
 
 		 1274 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  53.04 
 
 		 119 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 392 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 391 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 391 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3612  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 1245 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 		 1977 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  44.92 
 
 		 1053 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4302  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 1352 aa  104  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  40.71 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  43.33 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  43.33 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  39.17 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0497  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.41839  hitchhiker  0.0000227207 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 964 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.54 
 
 		 1230 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 1245 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  45.76 
 
 		 803 aa  100  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  41.03 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.43 
 
 		 1356 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  42.74 
 
 		 1765 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 1131 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1786 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1788 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1792 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  46.28 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1784 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1782 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 		 1713 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1765 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 		 720 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 1236 aa  98.6  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 968 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  46.09 
 
 		 651 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1767 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1767 aa  98.2  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 		 685 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1767 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  43.36 
 
 		 1233 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  42.74 
 
 		 1763 aa  98.2  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 920 aa  98.2  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 228 aa  97.1  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1651 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  44.35 
 
 		 651 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 1166 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 		 1078 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1251 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  42.06 
 
 		 800 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 1161 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  38.79 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 1689 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  44.83 
 
 		 1560 aa  95.9  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1284 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1768 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 893 aa  95.9  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 		 1223 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>