More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1247 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  100 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.34 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  31.73 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  32.95 
 
 		 342 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.06 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 208 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  32.08 
 
 		 346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  32.44 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  32.81 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  36.76 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  27.72 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  30.99 
 
 		 341 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  28.87 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.12 
 
 		 342 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  51.67 
 
 		 424 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  49.18 
 
 		 370 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  44.93 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 476 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 391 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  30.26 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  45.22 
 
 		 556 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  44.19 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  45.76 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  28.82 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 214 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  47.32 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  34 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  45.9 
 
 		 150 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  41.55 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  42.64 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 150 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  39.84 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  33.7 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  39.52 
 
 		 170 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 333 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  43.18 
 
 		 193 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  38.84 
 
 		 207 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  41.13 
 
 		 450 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  38.82 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 532 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  38.82 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  37.42 
 
 		 454 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  43.22 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.07 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  41.59 
 
 		 188 aa  99  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  41.84 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  42.03 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.38 
 
 		 523 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  43.33 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  43.33 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  43.33 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  35.48 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  38.03 
 
 		 212 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  42.86 
 
 		 188 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  42.98 
 
 		 231 aa  95.5  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  41.53 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.67 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  42.5 
 
 		 170 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  41.67 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  37.9 
 
 		 178 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>