120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0302 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  100 
 
 
1878 aa  3927    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  30.46 
 
 
1780 aa  629  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.57 
 
 
1948 aa  560  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  30.64 
 
 
1784 aa  306  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.42 
 
 
1787 aa  236  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.6 
 
 
1759 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.94 
 
 
1741 aa  213  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.59 
 
 
1740 aa  209  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  26.26 
 
 
2097 aa  202  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  25.53 
 
 
2093 aa  164  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.58 
 
 
1602 aa  163  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  23.2 
 
 
2104 aa  151  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.24 
 
 
1543 aa  150  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.24 
 
 
1543 aa  150  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.07 
 
 
2104 aa  149  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  23.22 
 
 
2106 aa  149  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.07 
 
 
2104 aa  148  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.22 
 
 
1607 aa  141  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.49 
 
 
1525 aa  140  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.42 
 
 
2120 aa  139  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.12 
 
 
1542 aa  138  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.9 
 
 
1589 aa  134  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.79 
 
 
2104 aa  128  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.56 
 
 
1561 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  25.33 
 
 
1578 aa  120  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.62 
 
 
685 aa  114  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.65 
 
 
2113 aa  102  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  24.36 
 
 
2087 aa  101  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  25.55 
 
 
2113 aa  99.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.55 
 
 
2113 aa  100  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.55 
 
 
2113 aa  99.8  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  28.04 
 
 
2082 aa  97.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  24.96 
 
 
1422 aa  96.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.01 
 
 
1861 aa  95.9  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.27 
 
 
1695 aa  95.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.51 
 
 
1711 aa  93.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.24 
 
 
2213 aa  90.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  27.79 
 
 
1838 aa  90.5  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.5 
 
 
1698 aa  89.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 
1764 aa  89.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.27 
 
 
1741 aa  86.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.86 
 
 
1672 aa  86.3  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  25.26 
 
 
1704 aa  84.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.67 
 
 
2136 aa  83.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  28.42 
 
 
2125 aa  82.8  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.34 
 
 
2099 aa  81.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.42 
 
 
1723 aa  82  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.26 
 
 
1770 aa  81.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  25.27 
 
 
2224 aa  81.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  25.74 
 
 
2124 aa  80.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.9 
 
 
1711 aa  79.7  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  28.52 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.29 
 
 
1723 aa  79.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
1719 aa  79.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.17 
 
 
1722 aa  79.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.26 
 
 
1754 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.32 
 
 
1743 aa  75.9  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.29 
 
 
1734 aa  75.5  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.21 
 
 
1765 aa  75.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.38 
 
 
1725 aa  72.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.72 
 
 
959 aa  60.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.05 
 
 
1198 aa  58.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  31.91 
 
 
906 aa  57.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 
764 aa  57.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.23 
 
 
897 aa  57.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
762 aa  58.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.43 
 
 
812 aa  55.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
739 aa  55.5  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  40.66 
 
 
795 aa  55.5  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.76 
 
 
744 aa  55.5  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.43 
 
 
753 aa  55.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  33.04 
 
 
833 aa  55.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.31 
 
 
744 aa  54.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.36 
 
 
744 aa  53.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.16 
 
 
751 aa  53.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.04 
 
 
902 aa  53.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.75 
 
 
1053 aa  53.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
738 aa  52  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.28 
 
 
806 aa  51.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
778 aa  50.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  36.54 
 
 
797 aa  51.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 
740 aa  50.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.54 
 
 
815 aa  51.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.57 
 
 
803 aa  51.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.53 
 
 
773 aa  50.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  42.86 
 
 
736 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.56 
 
 
815 aa  50.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.48 
 
 
761 aa  49.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  32.04 
 
 
780 aa  50.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
807 aa  49.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  33.72 
 
 
1210 aa  49.3  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.93 
 
 
756 aa  48.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  24.77 
 
 
321 aa  48.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  23.75 
 
 
941 aa  48.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.88 
 
 
775 aa  48.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 
775 aa  48.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 
775 aa  48.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.9 
 
 
876 aa  47.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.67 
 
 
868 aa  47.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28 
 
 
972 aa  47.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>