More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2110 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  100 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1638  transcriptional regulator IclR-like protein  50.8 
 
 		 291 aa  228  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318022  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4926  transcriptional regulator IclR-like protein  46.06 
 
 		 198 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0909011  normal  0.863129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.71 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.69 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  33.84 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.48 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.88 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  37.04 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  37.44 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2434  transcriptional regulator, IclR family  35.05 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0257982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  31.08 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  34.52 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  33.19 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.91 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  38.01 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  31.98 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.74 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  33.17 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.39 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 285 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.59 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.59 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  34.33 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.34 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.59 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.59 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.34 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.84 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 255 aa  92  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  32.08 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  31.79 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  32.93 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  29.39 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  35 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 269 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.09 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>