168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02190  spermidine synthase  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5656  Spermine synthase  58.95 
 
 		 281 aa  348  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24640  spermidine synthase  53.29 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.845245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  27.89 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  28.27 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  28.27 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  28.79 
 
 		 567 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  27.19 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  29.54 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  28.97 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  25.91 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  30.2 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  28.27 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  28.21 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  26.13 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  26.88 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  25.62 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  28.63 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  25.27 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  28.14 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  26.96 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  25.79 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  26.61 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  27.47 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  26.98 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  28.51 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  26.87 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1286  spermidine synthase  24.5 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  26.07 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  28.5 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  24.5 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  26.58 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  26.96 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  29.26 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  27.02 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  26.02 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  26.45 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  29.84 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  27 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  25.85 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  25.85 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  24.23 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  26.96 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  25.65 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  29.82 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  26.4 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  26.61 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  26.4 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  26.4 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  27.7 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18161  spermidine synthase  23.6 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  26.07 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  28 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  28.36 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  30.26 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  22.37 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  26.25 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  22.98 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0583  spermidine synthase  28.19 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  27.13 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  25.27 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4189  spermidine synthase  20.86 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  25.75 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  27.17 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  23.35 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  24.2 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  23.79 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  26.98 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  27 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  30.26 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  25.42 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  28.37 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0521  spermidine synthase  25.6 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  24.3 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25.65 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0273  spermidine synthase  24.34 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000512429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  23.55 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  22.75 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  26.88 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  25.09 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  24.09 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  29.84 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  23.4 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  23.4 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  23.48 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  25.71 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0906  spermidine synthase  23.65 
 
 		 570 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.975863  normal  0.296256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  26.13 
 
 		 528 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  27.69 
 
 		 529 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  25.25 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  24.36 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  23.68 
 
 		 498 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>