More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4225 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  83.12 
 
 		 239 aa  377  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  33.62 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  31.42 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  32.6 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  33.48 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  33.05 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.16 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  42.4 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 231 aa  89.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  31.67 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.37 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.85 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.84 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.14 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  28.7 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  30.35 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  26.38 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  39.13 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  26.38 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  26.38 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  27.66 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.28 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  30.04 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  33.11 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.6 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  30.04 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.04 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  30.04 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  27.95 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  30.04 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  30.13 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.6 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.6 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  24.78 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.97 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  34.34 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  24.78 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  24.78 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  37.7 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  24.78 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  25.97 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  25.21 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  25 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  29.46 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.12 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.12 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.12 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  25.44 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.12 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.12 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.1 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  28.44 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  25.54 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  36.88 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  23.81 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.64 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  33.33 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.4 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  25.65 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  27.57 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.16 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  25.65 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  33.05 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  34.65 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.5 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>