190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3978 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3978  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 177 aa  348  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4363  heat shock protein Hsp20  78.53 
 
 		 175 aa  266  8e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1214  molecular chaperone (small heat shock protein)  30.94 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  34.56 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1920  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143113  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1569  heat shock protein Hsp20  28.15 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  27.78 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  31.25 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1568  heat shock protein Hsp20  30.07 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  39.53 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2174  heat shock protein Hsp20  28.87 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.150669  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  34 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1725  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1296  heat shock protein Hsp20  34.34 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  30.08 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2683  heat shock protein Hsp20  29.2 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  34.69 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  25.95 
 
 		 139 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  22.83 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  24.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  30.66 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  35.05 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4198  heat shock protein Hsp20  24.63 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  27.66 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  27.7 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  25.19 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  32.14 
 
 		 149 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  24.29 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  27.94 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  24.29 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  29.71 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  35.35 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  26.62 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  31.58 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  29.81 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  26.43 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0423  heat shock protein Hsp20  27.61 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  28.87 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1365  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.117276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1434  low molecular weight heat shock protein  28.97 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  29.36 
 
 		 105 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14610  heat shock protein Hsp20  24.17 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000610495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2063  heat shock protein Hsp20  28.35 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.21571  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  32.74 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  29.93 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  38.2 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  25.35 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  21.38 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2564  heat shock protein Hsp20  35.48 
 
 		 123 aa  47.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  28.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  35.71 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  28.47 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  28.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2008  HSP20 family protein  27.27 
 
 		 122 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.291255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  28.26 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1029  Hsp20/alpha crystallin family protein  27.55 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00339514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  27.34 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  34.02 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7806  putative small heat-shock protein molecular chaperone  26.56 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00540773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4132  heat shock protein Hsp20  22.86 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  28.68 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  29.9 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2891  heat shock protein Hsp20  28.7 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.457656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  27.08 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0311  heat shock protein Hsp20  31.31 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.368561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  26.9 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6319  heat shock protein Hsp20  28.97 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  34.41 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  34.74 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0836  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.414458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  29.25 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  27.03 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  34.26 
 
 		 130 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  29.86 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0537  heat shock protein Hsp20  28.42 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  28.44 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  28.89 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  27.21 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1762  heat shock protein Hsp20  25.55 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1983  heat shock protein Hsp20  24.67 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00684856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  26.81 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  27.54 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  31.78 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  27.54 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  27.54 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>