More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2104 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  93.3 
 
 		 209 aa  390  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  67.65 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  58.8 
 
 		 222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  50 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  49.54 
 
 		 227 aa  208  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  55.14 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  46.43 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  57.36 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  48.77 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  46.73 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  45.33 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  52.68 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  45.62 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  46.98 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  52.66 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  50.24 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  40.23 
 
 		 184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  40.23 
 
 		 184 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  34.95 
 
 		 182 aa  97.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  36.13 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.03 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  34.02 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  34.03 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.17 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  32.81 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  47.89 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.17 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.29 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25.85 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.5 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.53 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  31.4 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30.16 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.89 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.98 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.88 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.89 
 
 		 166 aa  62  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  29.23 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  29.23 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.1 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.09 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  32.69 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.69 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  40 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.28 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.13 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.65 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.21 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.89 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  54 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.64 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  43.64 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.74 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.26 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  35.25 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  50 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.85 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.85 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.43 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4170  Nitroreductase-like protein  25.93 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  34.25 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  28.35 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.42 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  46.03 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.93 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.67 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.23 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.89 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  44.78 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.02 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.69 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  38.33 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.92 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.03 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.67 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.56 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  53.12 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  28.57 
 
 		 321 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  39.29 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  45.16 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.48 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  36.49 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  28.06 
 
 		 321 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.73 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  44.44 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  44.44 
 
 		 411 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  31.12 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.61 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  44.44 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  40 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  44.44 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  50 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.2 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  33.66 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>