More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3627 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3627  inner-membrane translocator  100 
 
 		 309 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2116  inner-membrane translocator  59.8 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0563  inner-membrane translocator  56.82 
 
 		 322 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  34.18 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  32.31 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.01 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 445 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  32.65 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4444  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  32.76 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.95 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  31.76 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 319 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 319 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0007  ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.785544  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0004  ABC transporter, permease protein  34.59 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0611392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 447 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.01 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 322 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  30.98 
 
 		 435 aa  146  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  29.35 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  29.03 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 429 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  29.03 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  32 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  32 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2124  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  32.62 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  28.11 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  30.2 
 
 		 323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  30.58 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  30.34 
 
 		 394 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  29.83 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.97 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  31.88 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.39 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  29.02 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  30.21 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 426 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  30 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4192  inner-membrane translocator  29.96 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  30.23 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  30.42 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 426 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  29.86 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>