82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2574 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  92.75 
 
 
192 aa  362  2e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  91.19 
 
 
192 aa  358  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  91.19 
 
 
192 aa  357  7e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  90.67 
 
 
195 aa  351  4e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  91.71 
 
 
193 aa  351  4e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  89.64 
 
 
193 aa  350  1e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  89.12 
 
 
191 aa  321  4e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  47.74 
 
 
229 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  47.45 
 
 
229 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  47.45 
 
 
229 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  44.33 
 
 
215 aa  164  8e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  44.83 
 
 
213 aa  164  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  44.83 
 
 
213 aa  164  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  43.81 
 
 
222 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 
216 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  44.62 
 
 
216 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  42.56 
 
 
244 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  43.08 
 
 
216 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  43.08 
 
 
216 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  42.05 
 
 
216 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  42.56 
 
 
216 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  39.23 
 
 
209 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  38.67 
 
 
195 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  44.63 
 
 
197 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  43.85 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  37.76 
 
 
207 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  43.96 
 
 
201 aa  131  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  39.7 
 
 
197 aa  131  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  42.25 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  42.69 
 
 
202 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  41.09 
 
 
216 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  39 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  41.71 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  38.97 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  38.97 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  43.26 
 
 
209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  35.75 
 
 
208 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  31.47 
 
 
203 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  31.47 
 
 
203 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  34.72 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.84 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  37.06 
 
 
201 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  36.95 
 
 
196 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  37.22 
 
 
222 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  37.78 
 
 
222 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  36.41 
 
 
222 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  36.41 
 
 
209 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  36.87 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  35.45 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  32.22 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  37.04 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  31.67 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  31.64 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  36.69 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  31.64 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  27.64 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  29.78 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  30.68 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  32.89 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  32.17 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  35.61 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  29.23 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  28.99 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  36.03 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  31.58 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  24.37 
 
 
205 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  31.97 
 
 
162 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  23.73 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  38.46 
 
 
74 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
74 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  33.33 
 
 
116 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  34.92 
 
 
295 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0196  putative site-specific integrase-resolvase, degenerate  39.34 
 
 
63 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000193839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3461  regulatory protein, MerR  34.62 
 
 
128 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2288  site-specific integrase-resolvase-like protein  37.31 
 
 
69 aa  45.1  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  31.06 
 
 
502 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  33.33 
 
 
137 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>