More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1828 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 405 aa  823    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  59.36 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  40.76 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  40.42 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  38.18 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  36.54 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  36.36 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  36.52 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  34.43 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  35.16 
 
 		 484 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  34.64 
 
 		 482 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  34.11 
 
 		 492 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  34.38 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  35.41 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  33.42 
 
 		 507 aa  203  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  34.69 
 
 		 474 aa  202  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  33.86 
 
 		 497 aa  192  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  32.11 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  32.9 
 
 		 497 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  31.41 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  32.17 
 
 		 467 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  32.08 
 
 		 476 aa  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  31.38 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  29.67 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  29.97 
 
 		 483 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  34.17 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  31.06 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  27.97 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  29.02 
 
 		 892 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  29.39 
 
 		 498 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  34.25 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  34.04 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.78 
 
 		 329 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  33.81 
 
 		 320 aa  96.7  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  32.55 
 
 		 322 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  30.84 
 
 		 326 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  32.21 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  30.87 
 
 		 329 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  33.49 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  26.32 
 
 		 1092 aa  93.2  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.71 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  31.7 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  30.33 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  26.16 
 
 		 1001 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  24.93 
 
 		 764 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  31.25 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  29.46 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  23.97 
 
 		 942 aa  87  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  26.98 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.09 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.63 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  27.57 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  27.68 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  34.8 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  28.47 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.24 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  29.87 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.3 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  28.98 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  29.33 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  30.52 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  26.17 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  28.51 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  28.69 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  30.54 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  27.78 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  26.76 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  26.42 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  26.76 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  24.17 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1879  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.24 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  30.1 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  27.06 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  27.6 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  27.14 
 
 		 1015 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  29.56 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  27.1 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  25.85 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3142  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.84 
 
 		 637 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  24.76 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  32.65 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  28.99 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  27.07 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  27.72 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.77 
 
 		 605 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00653224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.47 
 
 		 602 aa  69.7  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  28.31 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  27.1 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  25.74 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  26.29 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  23.33 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.84 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  27.47 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.330023  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.96 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.96 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  30.14 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  29.17 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.6 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  28.74 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  26.07 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>