More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1013 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
380 aa  754    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  52.41 
 
 
375 aa  379  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  33.69 
 
 
386 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  28.38 
 
 
380 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  26.22 
 
 
399 aa  94  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  27.44 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  28.38 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1627  putative signal transduction protein with CBS domains  24.02 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.759399 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2156  CBS domain containing membrane protein  25.29 
 
 
385 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  28.38 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  27.27 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  23.27 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.35 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  23.4 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  21.1 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  22.52 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  25 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25.74 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  31.06 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.09 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.35 
 
 
769 aa  66.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  24.12 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  24.62 
 
 
279 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  27.21 
 
 
208 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  28.4 
 
 
252 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  23.86 
 
 
258 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  28.89 
 
 
209 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  22.67 
 
 
269 aa  62.8  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3545  CBS domain containing protein  22.22 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  24.34 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  23.57 
 
 
258 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  27.05 
 
 
250 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  23.57 
 
 
259 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  26.37 
 
 
291 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  24.62 
 
 
315 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  23.83 
 
 
279 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  25.45 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  22.61 
 
 
279 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  27.66 
 
 
213 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 
282 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.51 
 
 
877 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 
170 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  26.85 
 
 
214 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  27.54 
 
 
140 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  27.21 
 
 
907 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  29.46 
 
 
881 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  27.91 
 
 
143 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  21.79 
 
 
281 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 
279 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  25.1 
 
 
261 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1815  signal-transduction protein  20.79 
 
 
375 aa  56.2  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
280 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  31.78 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  29.46 
 
 
142 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  31.17 
 
 
158 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3809  putative signal transduction protein with CBS domains  22.01 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  28.36 
 
 
212 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  27.52 
 
 
153 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
232 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  30.66 
 
 
145 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  23.11 
 
 
260 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  28.79 
 
 
215 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  28.06 
 
 
880 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  27.52 
 
 
153 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.85 
 
 
153 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  27.41 
 
 
187 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  26.92 
 
 
909 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  28.21 
 
 
160 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  22 
 
 
283 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 
143 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  30.94 
 
 
142 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30 
 
 
863 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 
236 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  26.87 
 
 
212 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  25.6 
 
 
258 aa  53.1  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.86 
 
 
903 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  25.09 
 
 
282 aa  53.5  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  26.47 
 
 
211 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 
280 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  25.6 
 
 
281 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  23.88 
 
 
287 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 
145 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  22.97 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  31.82 
 
 
216 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 
252 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.71 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  26.06 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.82 
 
 
216 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30.51 
 
 
145 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  23.65 
 
 
880 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  25 
 
 
867 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.76 
 
 
427 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  29.91 
 
 
127 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  25.83 
 
 
214 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.3 
 
 
277 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  29.82 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  22.91 
 
 
688 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>