49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1048 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  33.94 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  33.03 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  30.14 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04335  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  22.03 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  26.77 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  23.61 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1694  CBS domain-containing protein  20.83 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  24.28 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  22.97 
 
 		 380 aa  52.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  28.74 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  26.11 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  26.96 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  25 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  24.66 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1247  CBS domain-containing protein  24.18 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  28.67 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  29.46 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.84 
 
 		 916 aa  45.4  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  22.73 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  23.72 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  23.81 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  25.29 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1446  CBS domain-containing protein  22.3 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  23.57 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1487  CBS domain protein  22.3 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  23.65 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1224  hypothetical protein  22.3 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  23.56 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  24.39 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 154 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  24.39 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  25.53 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1116  CBS domain-containing protein  24.55 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.956192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  22.45 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.67 
 
 		 508 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 120 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1348  CBS domain-containing protein  21.58 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1421  CBS domain protein  21.58 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0200653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1222  hypothetical protein  21.58 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00319032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1249  CBS domain-containing protein  21.58 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  24.04 
 
 		 215 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  28.3 
 
 		 283 aa  42  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>