21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1323 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  41.33 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1043  putative signal transduction protein with CBS domains  43.86 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000177571  hitchhiker  0.0000212984 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  36.65 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  27.5 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  23.61 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1694  CBS domain-containing protein  20.96 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  27.75 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  23.3 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  21.18 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  20.67 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04335  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  24.14 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.69 
 
 		 286 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  27.17 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  26.47 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  22.73 
 
 		 223 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  31.62 
 
 		 434 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  19.89 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>