130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2720 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  100 
 
 		 220 aa  436  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  28.7 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  26.48 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  28.32 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  30.14 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  32.09 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  25.51 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  23.96 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  23.61 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  26.6 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  19.81 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.54 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  26.88 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  22.75 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  25.12 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  19.32 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  19.32 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  30.53 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  20.87 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  21.84 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  21.33 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  20.98 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  25.71 
 
 		 485 aa  53.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  19.32 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  18.84 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  18.84 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  18.84 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  18.84 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  24.87 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  22.41 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  18.84 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  18.84 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 		 636 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  18.84 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  27.14 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 136 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  29.31 
 
 		 142 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  26.92 
 
 		 437 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  26.92 
 
 		 437 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  26.92 
 
 		 437 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  26.92 
 
 		 437 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1116  CBS domain-containing protein  26.98 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.956192  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  27.55 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  27.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  28.08 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.45 
 
 		 520 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.45 
 
 		 520 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.63 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  26.11 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  30.93 
 
 		 513 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  30.93 
 
 		 513 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  28.12 
 
 		 640 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  26.04 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  25 
 
 		 437 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  26.92 
 
 		 437 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.63 
 
 		 504 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  25.96 
 
 		 437 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  25.96 
 
 		 437 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  25.96 
 
 		 437 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  25.96 
 
 		 437 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  25.96 
 
 		 437 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  20.45 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  30.63 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1043  putative signal transduction protein with CBS domains  22.84 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000177571  hitchhiker  0.0000212984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  27.93 
 
 		 513 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  22.32 
 
 		 489 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.04 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.47 
 
 		 500 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.18 
 
 		 689 aa  47  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  29.46 
 
 		 435 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.71 
 
 		 454 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  24.12 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  30.53 
 
 		 125 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  23.76 
 
 		 486 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 		 386 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.75 
 
 		 493 aa  45.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  24.52 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  31.3 
 
 		 133 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  27.83 
 
 		 162 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  27.72 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1465  CBS domain-containing protein  20.51 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.969653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.04 
 
 		 484 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 		 154 aa  45.1  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0468  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  24.51 
 
 		 258 aa  45.1  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  20.35 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  21.08 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.17 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.43 
 
 		 514 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  26.87 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  27.5 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  22.99 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>