24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1360 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  53.48 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  53.28 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  49.13 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1043  putative signal transduction protein with CBS domains  39.56 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000177571  hitchhiker  0.0000212984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  36.61 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  22.41 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  23 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  29.69 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  24.41 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  24.56 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  26.12 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  24.49 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  23.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  23.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  18.49 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  23.47 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>