32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1257 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1257  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00289092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1331  CBS domain-containing protein  66.38 
 
 		 229 aa  311  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.576096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1360  putative signal transduction protein with CBS domains  53.48 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  43.48 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0902  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1323  putative signal transduction protein with CBS domains  41.33 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1043  putative signal transduction protein with CBS domains  36.16 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000177571  hitchhiker  0.0000212984 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.09 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  23.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  26.05 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  28 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  25 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  24.15 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  19.83 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  25.6 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  23.72 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  27.27 
 
 		 378 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04335  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  20.69 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  23.44 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  25.3 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  22.92 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  23.2 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  30.1 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  22.31 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  22.4 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  22.4 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  22.4 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  22.4 
 
 		 214 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  27.03 
 
 		 280 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  22.4 
 
 		 214 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  22.4 
 
 		 214 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>