12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1116 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1116  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.956192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1694  CBS domain-containing protein  39 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04335  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  35.71 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3892  CBS domain containing protein  32.69 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3407  hypothetical protein  22.56 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.476966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0657  CBS domain containing protein  29.91 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2720  CBS domain containing protein  26.98 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.934738  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  23.15 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0982  CBS domain containing protein  22.06 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.646716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1048  CBS domain containing protein  24.55 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  25 
 
 		 144 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1018  hypothetical protein  23.11 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0419012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>