More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9220 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9220  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 393 aa  787    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3466  DNA polymerase III subunit delta'  72.82 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4955  DNA-directed DNA polymerase  62.37 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405656  normal  0.601805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2782  DNA polymerase III subunit delta'  61.18 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4543  DNA polymerase III, delta prime subunit  61.07 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32580  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  51.53 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0576  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.51 
 
 		 378 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0843  DNA polymerase III subunit delta'  50.52 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0610  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.52 
 
 		 386 aa  336  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0430331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0743  DNA-directed DNA polymerase  49.74 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0355  DNA polymerase III, delta prime subunit  51.65 
 
 		 381 aa  326  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35780  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.64 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39309  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8400  DNA polymerase III subunit delta'  48.62 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4022  DNA polymerase III, delta prime subunit  52.67 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  49.37 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2193  DNA-directed DNA polymerase  46.29 
 
 		 385 aa  311  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0842  DNA polymerase III subunit delta'  47.36 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0562145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0294  DNA-directed DNA polymerase  50.63 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0716  DNA polymerase III subunit delta'  46.95 
 
 		 380 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13673  DNA polymerase III subunit delta'  47.85 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0731009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4403  DNA polymerase III, delta prime subunit  53.19 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.424002  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5394  DNA polymerase III subunit delta'  46.97 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4794  DNA polymerase III subunit delta'  45.96 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.671879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4880  DNA polymerase III subunit delta'  45.96 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5180  DNA polymerase III subunit delta'  46.21 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0490  DNA polymerase III subunit delta'  48.73 
 
 		 392 aa  292  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.795068  hitchhiker  0.00546024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1396  DNA polymerase III subunit delta'  48.17 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.305059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0662  AAA ATPase  48.09 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.300478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0578  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.5 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4307  DNA polymerase III subunit delta'  47.98 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0307  DNA polymerase III subunit delta'  46.57 
 
 		 418 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.213292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1970  DNA polymerase III, delta prime subunit  47.56 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3874  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.91 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03680  DNA polymerase III, delta' subunit  45.31 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0117112  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24860  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  45.36 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  42.12 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0366865  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1274  DNA polymerase III subunit delta'  36.73 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1271  DNA polymerase III, delta' subunit family protein  32.08 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.130889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.09 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.09 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.51 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.94 
 
 		 382 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.38 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  28.53 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.64 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  41.38 
 
 		 298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.77 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.57 
 
 		 320 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000154633 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.65 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  36.26 
 
 		 579 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.34 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  37.43 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  33.69 
 
 		 595 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  37.43 
 
 		 584 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.25 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.06 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.19 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  30.14 
 
 		 320 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  25.39 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000590012  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  24.93 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5665  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.86 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.59 
 
 		 914 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.69 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.63 
 
 		 930 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.12 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1255  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.66 
 
 		 526 aa  106  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.01 
 
 		 554 aa  106  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.97 
 
 		 588 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.98 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00641  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.09 
 
 		 604 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.71 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  31.82 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.23 
 
 		 589 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  24.93 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.56 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  23.43 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.27 
 
 		 501 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.84 
 
 		 735 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1123  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.31 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.920332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.59 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.14 
 
 		 612 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0058  DNA-directed DNA polymerase  33.18 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1217  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.31 
 
 		 601 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  31.76 
 
 		 801 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1855  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.36 
 
 		 587 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225715  normal  0.416564 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.85 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17841  DNA polymerase, gamma and tau subunits  28.57 
 
 		 578 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1293  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.64 
 
 		 509 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0571  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.64 
 
 		 509 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.337724  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1174  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.64 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.630806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0102  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.64 
 
 		 635 aa  101  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  36.78 
 
 		 900 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1458  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.22 
 
 		 723 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.02 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.68 
 
 		 807 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2802  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  33.33 
 
 		 556 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  34.12 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  35.67 
 
 		 614 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  34.12 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>