More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6467 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  64.94 
 
 		 462 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 		 551 aa  1135    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  35.08 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  33.7 
 
 		 461 aa  260  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.33 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  33.33 
 
 		 456 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  36.25 
 
 		 460 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  33.64 
 
 		 431 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  33.41 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  36.41 
 
 		 455 aa  212  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  33.94 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  32.45 
 
 		 539 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  29.4 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  26.3 
 
 		 691 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27 
 
 		 533 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.63 
 
 		 544 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.07 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.79 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  26.15 
 
 		 691 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.71 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.51 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.43 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.43 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4687  hypothetical protein  62.65 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386758  normal  0.0918125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.49 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  30.07 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.68 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.14 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.99 
 
 		 691 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.99 
 
 		 691 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.37 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.72 
 
 		 691 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  32.32 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.23 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.17 
 
 		 691 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.08 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.49 
 
 		 567 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.85 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.4 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.25 
 
 		 601 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  25.3 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  27.35 
 
 		 694 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  26.72 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.18 
 
 		 588 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.58 
 
 		 595 aa  108  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  23.42 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.12 
 
 		 681 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.38 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.86 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  29.01 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  22.53 
 
 		 803 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  27.7 
 
 		 694 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  27.09 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  24.63 
 
 		 620 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  31.18 
 
 		 2457 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  27.97 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  24.07 
 
 		 603 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.07 
 
 		 507 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  27.62 
 
 		 417 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.17 
 
 		 513 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  27.51 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.74 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.07 
 
 		 526 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  31.03 
 
 		 436 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  25.7 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.04 
 
 		 514 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 481 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.6 
 
 		 531 aa  99.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 481 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.92 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.78 
 
 		 367 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  24.5 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  26.26 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  26.42 
 
 		 476 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.08 
 
 		 530 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.41 
 
 		 519 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.86 
 
 		 834 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.1 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.43 
 
 		 1032 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.4 
 
 		 503 aa  97.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.16 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.06 
 
 		 582 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.28 
 
 		 497 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  21.33 
 
 		 526 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  27.84 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.84 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  31.98 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  29 
 
 		 481 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  29.45 
 
 		 613 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1171  beta-lactamase  21.99 
 
 		 455 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  24.75 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.06 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  27.84 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  27.84 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.57 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>