More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6465 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  67.92 
 
 		 481 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  100 
 
 		 484 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  58.94 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  60.38 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  61.93 
 
 		 630 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.45 
 
 		 502 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.28 
 
 		 583 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  40.42 
 
 		 518 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  42.67 
 
 		 483 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.89 
 
 		 564 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 477 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  42.46 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1069  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  45.2 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 488 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 528 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  40.09 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.16 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 471 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 485 aa  249  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 487 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 486 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  37.71 
 
 		 473 aa  239  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 486 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  36.82 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  35.8 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 467 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 505 aa  213  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 524 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 459 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 504 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 480 aa  204  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  35.81 
 
 		 481 aa  203  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1209  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 486 aa  202  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  32.89 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.28 
 
 		 478 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 473 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 527 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  35.13 
 
 		 467 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 490 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  35.89 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 500 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 509 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 505 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 		 522 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.88 
 
 		 488 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 479 aa  190  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 469 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  32.57 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 551 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 609 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 480 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 512 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 627 aa  186  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.55 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  34.89 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 484 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 		 514 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 541 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.16 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.35 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.34 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>