162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5094 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  224  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  51.96 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  52.38 
 
 		 134 aa  110  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  52.94 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  51.96 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  58.14 
 
 		 100 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  45.24 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  35.63 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0103  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.917179  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0106  transcriptional regulator, HxlR family  34.07 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  35.34 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  36.78 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 223 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 223 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 223 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  36.67 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36.08 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  28.42 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3135  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0897  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2730  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.42105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3172  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1879  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2016  transcriptional regulator, putative  34.65 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3189  transcriptional regulator, putative  37.14 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0929776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3019  transcriptional regulator, HxlR family  27.18 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.179056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 229 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  32.65 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  31.96 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 228 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  30.84 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  24.32 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  31.91 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  34.65 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1430  transcriptional regulatory protein  34.65 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0141  HxlR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.360575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2765  transcriptional regulator, HxlR family  34.88 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  26.17 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  30.21 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  31.73 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  28.71 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1097  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  31.07 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2645  transcriptional regulator, HxlR family  25.45 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1421  transcriptional regulator, HxlR family  30.1 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  32.95 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4858  hypothetical protein  34.62 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  31.4 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5362  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675608  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4040  HxlR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.232895  normal  0.0486648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  36.78 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  34.12 
 
 		 246 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0580  transcriptional regulator, HxlR family  34.91 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0795968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  31.11 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>