196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3051 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  73.93 
 
 
257 aa  397  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  67.32 
 
 
257 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  61.18 
 
 
256 aa  320  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  58.66 
 
 
260 aa  319  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  57.48 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  58.27 
 
 
262 aa  306  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  53.73 
 
 
260 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  54.47 
 
 
267 aa  277  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  51.76 
 
 
259 aa  271  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  50.19 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  49.41 
 
 
270 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  50.39 
 
 
259 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  48.82 
 
 
259 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  47.84 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  49.42 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  48.25 
 
 
258 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  47.74 
 
 
268 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  35.48 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  36.71 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  36.44 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  35.15 
 
 
275 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  31.25 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  34.31 
 
 
275 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  32.28 
 
 
272 aa  131  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  33.06 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  35.08 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  35.08 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  35.05 
 
 
237 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  32.71 
 
 
244 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  32.35 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  32.35 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  40 
 
 
249 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  36.51 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  30.38 
 
 
247 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  33.65 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  34.67 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  35.18 
 
 
268 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  29.83 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  32.26 
 
 
248 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  33.87 
 
 
244 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  29.41 
 
 
249 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  32.39 
 
 
269 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  35.83 
 
 
249 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  33.16 
 
 
247 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  29.05 
 
 
243 aa  102  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  29.75 
 
 
265 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  31.55 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  30.54 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  34.67 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  32.41 
 
 
278 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  27.16 
 
 
231 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  26.72 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  31.82 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  31.56 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.26 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  24.31 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  35.02 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  31.09 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  31.71 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  31.28 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  26.74 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  26.45 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  29.85 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  31.66 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  25.69 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  29.93 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  26.25 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  29.17 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0257  cyclase family protein  27.27 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  32.38 
 
 
210 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.21 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.26 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  27.8 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.31 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.31 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  31.73 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  29.41 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  24.38 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.31 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.9 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.9 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  33.33 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.2 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  24.9 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  27.42 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  29.8 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.06 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  30.58 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18600  predicted metal-dependent hydrolase  29.93 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16260  cyclase family protein  27.13 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  30.42 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  24.9 
 
 
210 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  25.67 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  27.32 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  29.11 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  26.09 
 
 
205 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  24.08 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  26.94 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  30.5 
 
 
216 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>