More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4233 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4233  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 215 aa  447  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1816  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1706  transglycosylase slt family protein  59.64 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.190325  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2629  transglycosylase slt family protein  59.64 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00160181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2359  lytic transglycosylase, catalytic  48.72 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35474  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01168  lytic murein endotransglycosylase E  47.69 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.349324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2455  Lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1295  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  47.69 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0532934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2432  lytic transglycosylase catalytic  47.69 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.283102  normal  0.357576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01178  hypothetical protein  47.69 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1338  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  47.69 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.243882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1680  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  47.69 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  normal  0.45988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1351  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  47.69 
 
 		 241 aa  177  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1955  membrane-bound lytic murein transglycosylase E  47.18 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  0.211884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3368  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0187243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3409  murein transglycosylase C  42.68 
 
 		 374 aa  151  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.168734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3106  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368993 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0751  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 360 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4267  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59829  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02793  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0732  Lytic transglycosylase catalytic  44.51 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3309  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3396  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02756  hypothetical protein  44.51 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.128702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3208  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3124  murein transglycosylase C  44.51 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0880  murein transglycosylase C  42.07 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3352  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 361 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4045  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 358 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171156 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3360  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 361 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.0857265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3286  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 361 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548913  normal  0.0418173 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3455  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 361 aa  147  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3028  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 360 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3276  murein transglycosylase C  43.29 
 
 		 361 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0477  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  43.56 
 
 		 340 aa  145  3e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0327755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0818  murein transglycosylase C  41.46 
 
 		 362 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.477613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0817  murein transglycosylase C  41.46 
 
 		 358 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0153  murein transglycosylase C  41.46 
 
 		 358 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643925 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1669  murein transglycosylase C  45.22 
 
 		 363 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0001  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  42.59 
 
 		 375 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0532  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  40.48 
 
 		 378 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000712177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002444  membrane-bound lytic murein transglycosylase C precursor  41.72 
 
 		 372 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000187183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03593  lytic murein transglycosylase  41.1 
 
 		 376 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03316  lytic murein transglycosylase  41.94 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1446  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  41.61 
 
 		 373 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1786  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  38.46 
 
 		 388 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3132  lytic transglycosylase catalytic  41.77 
 
 		 354 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3344  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 394 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.873835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4178  lytic transglycosylase catalytic  35.84 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1463  lytic transglycosylase, catalytic  34.72 
 
 		 413 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0177  Lytic transglycosylase catalytic  34.32 
 
 		 429 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0080  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 377 aa  108  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1595  lytic transglycosylase, catalytic  34.32 
 
 		 378 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2079  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 359 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.929188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0297  lytic transglycosylase, catalytic  36.26 
 
 		 385 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.277763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2724  lytic transglycosylase catalytic  32.9 
 
 		 519 aa  82  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03362  lytic murein transglycosylase  30.17 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2185  lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000212239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  41.74 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  39.82 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  40.17 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  43.02 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  38.05 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.77 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  38.46 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.66 
 
 		 649 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  34.43 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.21 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  31.18 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.71 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  36.84 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  33.1 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  37.78 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  42.22 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  41.46 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  38.18 
 
 		 661 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  39.17 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0944  lytic transglycosylase, catalytic  29.01 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3276  lytic transglycosylase, catalytic  37.08 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  46.05 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  34.78 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  43.96 
 
 		 650 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>