More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2543 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 298 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  70.82 
 
 		 298 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  67.92 
 
 		 294 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  70.91 
 
 		 297 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  38.46 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  36.05 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  35.69 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.36 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  34.98 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.42 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  31.64 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 351 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 335 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.3 
 
 		 341 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 348 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 284 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.64 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.35 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  28.75 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.37 
 
 		 494 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 270 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  29.07 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  28.92 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  28.82 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  28.82 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  28.82 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.43 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  32.04 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>