289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1055 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  100 
 
 		 193 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  50.8 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  53.48 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  43.02 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  42.25 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  43.95 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  37.37 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  42.33 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  42.33 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  42.33 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  37.37 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  37.31 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  31.22 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  31.22 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  31.22 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  31.22 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  33.33 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  38.1 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  38.1 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  38.1 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  38.1 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  32.7 
 
 		 165 aa  94.7  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  37.5 
 
 		 172 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  32.7 
 
 		 165 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  33.7 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  40.31 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  32.79 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  32.79 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  32.79 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  39.01 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  39.67 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  39.67 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  39.67 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  41.54 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  32.21 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  32.07 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  35.84 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  35.84 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  35.84 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  34.68 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  43.29 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  35.84 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  34.68 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  38.92 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  34.1 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  42.94 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  42.94 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  34.1 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  42.94 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  34.04 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  39.52 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  34.18 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  35.57 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  39.52 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  42.33 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  36.46 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  34.76 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  37.89 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  37.89 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  35.68 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  34.57 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  33.51 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  33.51 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  33.51 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  33.51 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  35.87 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  35.87 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  35.87 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  37.34 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  34.22 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  37.5 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  36.65 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  35.57 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  35.57 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  34.54 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  34.3 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  29.51 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.25 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  30.25 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  29.51 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  30.25 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  31.94 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  33.68 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  29.88 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  30.25 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  30.25 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.25 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  29.88 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.88 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  36.42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  28.96 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  30.39 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  29.27 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  29.27 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>