More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2527 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2527  transcriptional regulator  100 
 
 		 455 aa  946    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0148253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1966  transcriptional regulator  58.42 
 
 		 454 aa  552  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.138243  normal  0.104456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2383  GntR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1976  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  56.14 
 
 		 452 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568714  hitchhiker  0.000000155342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2486  transcriptional regulator  55.92 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11043  decreased coverage  0.000113199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2371  GntR family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 452 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2282  GntR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2134  GntR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 454 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1753  GntR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 452 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.719821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1833  GntR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2266  GntR family transcriptional regulator  55.04 
 
 		 460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.99423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2016  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1101  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2133  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 476 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2019  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 486 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.02 
 
 		 471 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 477 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0682  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.44 
 
 		 474 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000368055 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5391  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.87 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0539  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0353345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.95 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.38477  normal  0.137274 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5773  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6017  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.488047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2107  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.23 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1990  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.26 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0486  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1400  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.79 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2317  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6146  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 470 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0519  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6651  transcriptional regulator  28.51 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5806  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6170  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.590476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3290  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.70657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0243  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7573  transcriptional regulator GntR family  27.34 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0907  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.01 
 
 		 467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2733  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1108  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.35 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2001  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.577314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1306  putative HTH-type trancriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.734577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0608  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1054  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.7 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4429  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000708029 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5571  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6621  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 480 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.920064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3553  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0055  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 465 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484354  hitchhiker  0.00409512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2388  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 468 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1967  aminotransferase family protein  25.53 
 
 		 444 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4755  GntR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151442  normal  0.0255466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0701  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5339  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.89 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4375  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2041  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3856  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3848  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2173  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0314579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4502  transcriptional regulator  27.99 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3275  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3748  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0414  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1974  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2483  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0358309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2617  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.59 
 
 		 467 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.29152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2152  GntR family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 498 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1897  transcriptional regulator GntR family  27.17 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3968  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.96 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3954  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25.85 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.890066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2843  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1514  GntR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.508918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3865  transcriptional regulator  25.5 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3041  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.35 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6946  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.48 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3026  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.63 
 
 		 493 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1503  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0921845 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5513  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.19 
 
 		 461 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412768  decreased coverage  0.00050533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4954  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3799  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.83 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2764  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.55 
 
 		 477 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6790  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.82 
 
 		 487 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4044  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.19 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24687  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3480  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 481 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5878  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1408  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.01 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  25.86 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1386  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  25.86 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>