More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6085 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  82.55 
 
 		 228 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  81.6 
 
 		 228 aa  349  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  75.7 
 
 		 216 aa  311  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  73.61 
 
 		 229 aa  306  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  73.33 
 
 		 212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  72.64 
 
 		 212 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  71.29 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.83 
 
 		 219 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.81 
 
 		 223 aa  292  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.08 
 
 		 210 aa  292  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.05 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.89 
 
 		 223 aa  278  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  69.77 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.51 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.21 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.705317  normal  0.304873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.77 
 
 		 226 aa  268  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  66.82 
 
 		 229 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.4 
 
 		 226 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.98 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.21 
 
 		 218 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.75 
 
 		 223 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.03 
 
 		 226 aa  241  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.11 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  55.46 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.14 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  61.43 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  57.39 
 
 		 232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.93 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  44.23 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.23 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  40.48 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.59 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  43.54 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 234 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.23 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 253 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  37.8 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 1648 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.22 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 303 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.87 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  39.07 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  39.62 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  39.07 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  40.29 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 221 aa  138  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 230 aa  137  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  37.02 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  38.68 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  38.79 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  33.64 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>