More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5217 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5217  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  50.67 
 
 
461 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  50.81 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
451 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  32.61 
 
 
459 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.56 
 
 
447 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  31.3 
 
 
381 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  31.79 
 
 
436 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  30.21 
 
 
436 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  29.19 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
436 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  29.07 
 
 
436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.24 
 
 
455 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  28.54 
 
 
437 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.53 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  28.45 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.84 
 
 
457 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  24.88 
 
 
456 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
445 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
470 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  28.76 
 
 
464 aa  136  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.58 
 
 
399 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.46 
 
 
399 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.58 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.58 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.58 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.84 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.58 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.84 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  26.54 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.78 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  28.18 
 
 
382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.39 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  25.94 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.39 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
465 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.44 
 
 
425 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.77 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  29.87 
 
 
422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
451 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28.12 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
478 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.4 
 
 
449 aa  130  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
478 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
478 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  26.24 
 
 
476 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.24 
 
 
478 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28 
 
 
478 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.43 
 
 
464 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  26.22 
 
 
438 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28 
 
 
478 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.3 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.55 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  26.22 
 
 
485 aa  128  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.83 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.35 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
473 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.35 
 
 
474 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
380 aa  125  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28 
 
 
432 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 
438 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  25.97 
 
 
487 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  30.15 
 
 
415 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  30.08 
 
 
382 aa  124  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  27.83 
 
 
433 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  30.36 
 
 
372 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
433 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  29.02 
 
 
422 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  25.97 
 
 
487 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  27.29 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  27.29 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  27.83 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.07 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  27.29 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  27.3 
 
 
424 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  28.67 
 
 
432 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  28.5 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.9 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  25.97 
 
 
487 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  25.97 
 
 
487 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
456 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  25.88 
 
 
485 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  25.24 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  26.85 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.04 
 
 
432 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  25.54 
 
 
492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
458 aa  116  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  24.82 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  24.23 
 
 
485 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>