More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1817 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1817  amidohydrolase  100 
 
 
429 aa  862    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25204  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4603  amidohydrolase  29.07 
 
 
427 aa  179  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  32.64 
 
 
400 aa  162  7e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  30.9 
 
 
437 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  31.71 
 
 
390 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  29.01 
 
 
393 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  35.09 
 
 
395 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  32.46 
 
 
459 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  34.36 
 
 
387 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  35.22 
 
 
395 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  31.75 
 
 
431 aa  156  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  34.41 
 
 
395 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  32 
 
 
436 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  34.41 
 
 
395 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  34.41 
 
 
395 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  30.88 
 
 
465 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  29.52 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  29.22 
 
 
480 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7452  peptidase M20D, amidohydrolase  33.59 
 
 
416 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  34.46 
 
 
397 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  34.5 
 
 
388 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  31.3 
 
 
465 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  33.6 
 
 
396 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  33.33 
 
 
388 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  32 
 
 
447 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  33.08 
 
 
439 aa  149  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  34.92 
 
 
389 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  32.78 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  32.78 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  30.17 
 
 
391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  29.14 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  34 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  32.8 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  32.73 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  32.07 
 
 
400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  30.75 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  34.18 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  31.58 
 
 
387 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  33.33 
 
 
390 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  34.64 
 
 
384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  32.32 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  30.77 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  34.06 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  32.32 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.98 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  30.53 
 
 
415 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  29.4 
 
 
409 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  33.92 
 
 
388 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  33.42 
 
 
390 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  33.42 
 
 
385 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  27.83 
 
 
449 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  30.65 
 
 
407 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  32.93 
 
 
385 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  33 
 
 
406 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  29.68 
 
 
410 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  35.18 
 
 
388 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  33.42 
 
 
385 aa  144  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  32.32 
 
 
449 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  32.67 
 
 
392 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  31.19 
 
 
394 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  29.28 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  31.3 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.46 
 
 
401 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  33.33 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  30.67 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  35.44 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  32.91 
 
 
393 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  35.65 
 
 
388 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  31.61 
 
 
391 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  29.7 
 
 
390 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  31.61 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  32.89 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  30.63 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  31.54 
 
 
412 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  33.24 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  34.78 
 
 
397 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  26.52 
 
 
399 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  35.03 
 
 
391 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  32.29 
 
 
397 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  36.03 
 
 
385 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  32.41 
 
 
387 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  32.58 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  31.3 
 
 
430 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  30.69 
 
 
397 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  30.14 
 
 
435 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  33.08 
 
 
389 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  30.69 
 
 
395 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1812  amidohydrolase  35.11 
 
 
400 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  33.08 
 
 
399 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  32.82 
 
 
396 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  33.08 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  33 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  33.08 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  33.08 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  30 
 
 
402 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  31.58 
 
 
387 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  31.31 
 
 
382 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  28.57 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  32.44 
 
 
467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  33.59 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>