More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0833 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  93.42 
 
 		 467 aa  838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  100 
 
 		 480 aa  951    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  57.37 
 
 		 391 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  56.89 
 
 		 412 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  57.03 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  55.37 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  55.94 
 
 		 420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  54.45 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  53.35 
 
 		 412 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  53.7 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  53.85 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  52.52 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  50.26 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  50.67 
 
 		 418 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  53.65 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  52.66 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  50.78 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  48.52 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  48.59 
 
 		 395 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  49.47 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  49.07 
 
 		 401 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  47.45 
 
 		 399 aa  339  5e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  47.86 
 
 		 415 aa  338  9e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  46.28 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  49.74 
 
 		 421 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  49.61 
 
 		 391 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  47.07 
 
 		 399 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  47.68 
 
 		 413 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  49.74 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  50 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  46.91 
 
 		 418 aa  319  7e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  47.67 
 
 		 389 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  44.65 
 
 		 393 aa  309  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  36.27 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  36 
 
 		 394 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.67 
 
 		 398 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.67 
 
 		 398 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  39.37 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  40.86 
 
 		 393 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.34 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  37 
 
 		 386 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  37.83 
 
 		 392 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.4 
 
 		 400 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  39.31 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  39.26 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  36.67 
 
 		 381 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.04 
 
 		 391 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  36.53 
 
 		 381 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.58 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.79 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  36.36 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.76 
 
 		 390 aa  243  7e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  36.19 
 
 		 394 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.99 
 
 		 387 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  36.91 
 
 		 397 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  36.01 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  36.97 
 
 		 396 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  36.19 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.38 
 
 		 381 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.64 
 
 		 408 aa  240  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  35.83 
 
 		 386 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37 
 
 		 405 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  34.27 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.97 
 
 		 403 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  36.98 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  37.53 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  36.73 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  34.29 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  34.85 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.72 
 
 		 403 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  36.03 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  36.03 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.14 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  35.92 
 
 		 385 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  34.66 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  35.29 
 
 		 437 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  34.04 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  35.45 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  38.68 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  36.9 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  38.93 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  35.66 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  34.76 
 
 		 381 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  34.76 
 
 		 381 aa  230  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  35.62 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.13 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  36.5 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  35.66 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.13 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  34.13 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  33.86 
 
 		 389 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.13 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.13 
 
 		 389 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  34.13 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.17 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.44 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  37.01 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>