More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1019 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  838    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  71.58 
 
 
401 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  66.83 
 
 
415 aa  504  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  63.75 
 
 
399 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  69.15 
 
 
421 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  62.43 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  56.96 
 
 
413 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  57.29 
 
 
406 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  53.75 
 
 
399 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  53.41 
 
 
418 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  53.95 
 
 
399 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  52.9 
 
 
440 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  51.9 
 
 
420 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  54.43 
 
 
417 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  51.15 
 
 
418 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  54.47 
 
 
414 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  54.04 
 
 
412 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  52.94 
 
 
412 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  53.44 
 
 
410 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  52.47 
 
 
391 aa  359  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  48.96 
 
 
395 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  51.98 
 
 
423 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  49.2 
 
 
393 aa  343  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  49.6 
 
 
391 aa  342  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  48.62 
 
 
480 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  53.89 
 
 
426 aa  340  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  49.06 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  50 
 
 
415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  46.62 
 
 
467 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  50.93 
 
 
391 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  50.26 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 
390 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  50 
 
 
390 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  50.41 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.05 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  37.03 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  39.2 
 
 
393 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  37.02 
 
 
400 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  35.17 
 
 
394 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  34.46 
 
 
386 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  34.7 
 
 
394 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  36.5 
 
 
395 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.14 
 
 
396 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  36.25 
 
 
398 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.25 
 
 
398 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  35.99 
 
 
396 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.63 
 
 
398 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  39.33 
 
 
393 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  36.13 
 
 
392 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.37 
 
 
395 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.77 
 
 
403 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  36.72 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  32.89 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  36.48 
 
 
391 aa  219  5e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  35.84 
 
 
400 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  31.87 
 
 
392 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  33.68 
 
 
394 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  36.34 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  33.67 
 
 
409 aa  216  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  32.48 
 
 
394 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  32.12 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  32.71 
 
 
390 aa  216  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  34.18 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  34.32 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 
381 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  34.6 
 
 
404 aa  210  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  32.37 
 
 
392 aa  210  4e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  34.66 
 
 
395 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  31.62 
 
 
390 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.51 
 
 
391 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  33.33 
 
 
381 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  30.05 
 
 
390 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  32.31 
 
 
391 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  38.12 
 
 
392 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  36.25 
 
 
385 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  34.2 
 
 
393 aa  206  8e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  36.48 
 
 
396 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  32.89 
 
 
400 aa  205  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.98 
 
 
391 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.23 
 
 
381 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  34.55 
 
 
398 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.16 
 
 
401 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  31.69 
 
 
391 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  29.85 
 
 
393 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  33.92 
 
 
412 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  35.04 
 
 
408 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.82 
 
 
391 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.82 
 
 
391 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  35.28 
 
 
385 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  31.75 
 
 
391 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  34.81 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  31.37 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  34.24 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  37.43 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  35.6 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  31.64 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  33.16 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  34.74 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  36.13 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>