More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3950 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  100 
 
 
415 aa  798    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  60.36 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  62.37 
 
 
415 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  62.43 
 
 
428 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  57.69 
 
 
399 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  57.11 
 
 
421 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  55.53 
 
 
413 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  57.61 
 
 
406 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  54.92 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  55.98 
 
 
440 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  55.83 
 
 
412 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  54.26 
 
 
399 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  54.35 
 
 
412 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  54.01 
 
 
410 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  50.73 
 
 
418 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  51.59 
 
 
418 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  50.25 
 
 
420 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  53.03 
 
 
417 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  53.14 
 
 
392 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  53.02 
 
 
414 aa  360  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  53.59 
 
 
391 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  51.19 
 
 
393 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  50.79 
 
 
480 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  52.04 
 
 
391 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  51.78 
 
 
395 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  52.51 
 
 
423 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  53.4 
 
 
426 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  48.43 
 
 
467 aa  338  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  49.48 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  52.28 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  52.47 
 
 
390 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  52.47 
 
 
390 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  52.47 
 
 
390 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  50.92 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  37.63 
 
 
398 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  37.63 
 
 
398 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  40.78 
 
 
395 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  37.4 
 
 
395 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  43.55 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  37.5 
 
 
386 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  42.45 
 
 
393 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  36.56 
 
 
394 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  36.81 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  37.09 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  36.81 
 
 
392 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.86 
 
 
391 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  36.02 
 
 
394 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.41 
 
 
396 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  39.52 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  35.82 
 
 
400 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.3 
 
 
400 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  39.78 
 
 
396 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  36.15 
 
 
396 aa  232  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  35.45 
 
 
381 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  35.98 
 
 
410 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  33.51 
 
 
390 aa  229  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  35.44 
 
 
407 aa  229  7e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  36.29 
 
 
409 aa  229  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  36.53 
 
 
392 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.52 
 
 
398 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  34.66 
 
 
381 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  33.84 
 
 
395 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  34.93 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  36.2 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  34.84 
 
 
386 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  34.75 
 
 
381 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  36.41 
 
 
408 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.67 
 
 
381 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  36.04 
 
 
407 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  35.19 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.36 
 
 
396 aa  219  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  31.72 
 
 
390 aa  219  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  36.77 
 
 
373 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.93 
 
 
395 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  33.95 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  32.25 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.97 
 
 
394 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  35.95 
 
 
391 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  34.46 
 
 
388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  32.47 
 
 
415 aa  216  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  34.17 
 
 
397 aa  216  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  35.91 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  33.51 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  40.98 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  38.17 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  34.96 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  34.42 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  36.51 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  36.19 
 
 
398 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.82 
 
 
401 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.47 
 
 
389 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  38.04 
 
 
393 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  34.39 
 
 
391 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  36.54 
 
 
425 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.58 
 
 
403 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  33.05 
 
 
372 aa  210  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.52 
 
 
389 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.99 
 
 
387 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  35.5 
 
 
385 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  37.66 
 
 
396 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>