More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6414 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  100 
 
 
423 aa  830    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  74.76 
 
 
426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  60.31 
 
 
395 aa  474  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  63.1 
 
 
391 aa  471  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  61.33 
 
 
392 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  63.9 
 
 
390 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  63.64 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  63.37 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  63.37 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  63.03 
 
 
389 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  57.07 
 
 
393 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  55.87 
 
 
412 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  56.51 
 
 
410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  56.28 
 
 
415 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  54.86 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  55.7 
 
 
412 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  55.01 
 
 
440 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  52.64 
 
 
420 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  53.35 
 
 
415 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  53.66 
 
 
480 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  53.46 
 
 
418 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  50.9 
 
 
399 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  53.46 
 
 
401 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  53.68 
 
 
399 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  52.19 
 
 
406 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  52.88 
 
 
467 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  53.26 
 
 
399 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  52.52 
 
 
417 aa  362  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  51.98 
 
 
428 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  53.05 
 
 
414 aa  358  7e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  53.56 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  49.35 
 
 
418 aa  346  5e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  49.62 
 
 
421 aa  345  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  48.7 
 
 
413 aa  333  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  42.05 
 
 
395 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40.36 
 
 
392 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  38.34 
 
 
394 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  38.22 
 
 
395 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  38.34 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.9 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.9 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.95 
 
 
389 aa  252  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  39.3 
 
 
396 aa  252  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  37.3 
 
 
394 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.41 
 
 
394 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  40.11 
 
 
408 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  38.05 
 
 
425 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.44 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.47 
 
 
394 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.93 
 
 
403 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  40.48 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.54 
 
 
400 aa  243  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  42.08 
 
 
392 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.81 
 
 
391 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  39.11 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  35.01 
 
 
390 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  38.4 
 
 
386 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  39.15 
 
 
404 aa  239  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.29 
 
 
391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  36.6 
 
 
395 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  38.06 
 
 
409 aa  237  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  41.47 
 
 
393 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  36.7 
 
 
390 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.76 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  36.74 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1490  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.13 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1289  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.72 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1263  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.72 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.804068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1392  n-acyl-l-amino acid amidohydrolase  34.72 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  37.33 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  34.72 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  34.55 
 
 
392 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.52 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  35.45 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1261  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  34.46 
 
 
389 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1426  aminoacylase  34.75 
 
 
389 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  39.25 
 
 
398 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.27 
 
 
380 aa  233  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  39.08 
 
 
393 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1463  aminoacylase  34.46 
 
 
389 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  38.12 
 
 
392 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3918  aminoacylase  35.23 
 
 
389 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  37.8 
 
 
430 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  33.51 
 
 
391 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.77 
 
 
391 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  36.25 
 
 
403 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  33.25 
 
 
391 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  38.3 
 
 
407 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  38.62 
 
 
396 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.87 
 
 
381 aa  229  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.25 
 
 
391 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  39.78 
 
 
391 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.25 
 
 
391 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  38.83 
 
 
393 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.81 
 
 
406 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  36.29 
 
 
392 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  39.25 
 
 
389 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  35.47 
 
 
386 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  39.2 
 
 
391 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  37.05 
 
 
373 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>