More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25770  amidohydrolase  100 
 
 		 401 aa  790    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.336885  normal  0.797588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2948  amidohydrolase  73.85 
 
 		 415 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0823  amidohydrolase  70.33 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1019  amidohydrolase  71.58 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.533983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0993  amidohydrolase  69.11 
 
 		 421 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.491415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3950  amidohydrolase  60.36 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1206  amidohydrolase  57.14 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000127649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1133  amidohydrolase  56.57 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3542  amidohydrolase  55.32 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0576858  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21290  amidohydrolase  54.15 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0781  amidohydrolase  54.17 
 
 		 418 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04870  amidohydrolase  50.97 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.946218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4199  amidohydrolase  50.39 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5928  amidohydrolase  52.86 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  52.37 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0694  peptidase M20D, amidohydrolase  53.3 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2564  peptidase M20D, amidohydrolase  51.03 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0675  amidohydrolase  48.59 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.925294  normal  0.238039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1268  Aminoacylase  50.65 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1790  amidohydrolase  50.77 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0776  amidohydrolase  53.91 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4375  amidohydrolase  51.85 
 
 		 415 aa  359  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6414  amidohydrolase  53.46 
 
 		 423 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.820069  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1612  amidohydrolase  51.33 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0986  amidohydrolase  51.87 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05720  amidohydrolase  54.18 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1358  amidohydrolase  48.25 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.624162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0833  amidohydrolase  49.46 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.0130422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1246  peptidase M20D, amidohydrolase  52.39 
 
 		 390 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1263  amidohydrolase  52.39 
 
 		 390 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1273  amidohydrolase  52.13 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4826  amidohydrolase  52.39 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0777  amidohydrolase  47.03 
 
 		 467 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13334  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase amiA1  48.58 
 
 		 389 aa  323  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  41.28 
 
 		 395 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  35.42 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.28 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.28 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  38.8 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  41.13 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  38.56 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  35.31 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  35.05 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  33.68 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.22 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.98 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  38.5 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  38.34 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  36.73 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  36.48 
 
 		 405 aa  230  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  33.16 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  37.11 
 
 		 396 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  35.64 
 
 		 404 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  34.26 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  33.42 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  32.72 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  34.63 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  35.16 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  37.97 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  34.95 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  39.05 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  35.53 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  35.96 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  37.96 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  34.1 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  38.98 
 
 		 406 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  32.8 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  32.3 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  32.47 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  32.89 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  38.16 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  34.69 
 
 		 410 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  37.99 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.34 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  34.81 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.06 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  35.58 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  32.13 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.3 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  34.56 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  34.65 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  34.18 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  34.49 
 
 		 403 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  29.97 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  32.66 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  38.3 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  32.4 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  32.32 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  35.06 
 
 		 387 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  36.69 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  35.34 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  37.98 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  36.13 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  33.24 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  38.15 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2179  amidohydrolase  37.15 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.833898  normal  0.575344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  33.58 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  36.76 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  36.07 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  35.48 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>